印尼一直是世界上最好的咖啡生产地之一，爪哇咖啡曾经是咖啡的代名词，而苏门答腊和苏拉威西也盛产咖啡。咖啡17 世纪便被荷兰人带入，当时开始种植咖啡的还有锡兰(即斯里兰卡)，种的都是阿拉比卡咖啡。这种咖啡当时只供欧洲，要经历帆船长期运输，令咖啡酸度变得更低，味道也更好;航运发达时期，商人们则不得不将咖啡贮藏几年才能获得更好口味，贮藏也推高了价格，使得以次充好、各种走私屡见不鲜。1880 年爪哇咖啡达到鼎盛，但一种锈蚀病却袭击了爪哇岛在内的印尼许多地区，造成的咖啡树死去，整个印尼幸存的阿拉比卡咖啡只剩十分之一，且大部分在苏门答腊岛。之后虽荷兰人带来了更擅于抗病虫害的罗布斯塔咖啡，但因口味较阿拉比卡咖啡次，印尼咖啡亦风光不再。 保留下的旧日种植园多聚集在爪哇岛东部，包括Djampit, Blawan, Pancoer, 和 Kayumas4 个种植园，都在Ijen 高原的Ijen 火山附近，这些种植园从18 世纪到如今一直种着同一种咖啡。现在说起印尼咖啡更多指苏门答腊曼特宁咖啡，或鲁瓦克咖啡(Kopi Luwak，麝香猫咖啡)。鲁瓦克咖啡被称为世界上最昂贵的咖啡，主要产自苏门答腊、爪哇等岛屿，异常稀少。 这种最昂贵的东南亚咖啡被发现是因当时荷兰种植园主禁止本地工人饮用咖啡，而工人们为了获得自己种植的神奇果子只能另辟蹊径，竟在麝香猫的排泄物中找到，经过清洗研磨制成，后被荷兰人发现后变得更为昂贵。巴厘岛以黄金咖啡出名，其实就是苏门答腊的曼特宁咖啡中的特选品，又叫黄金曼特宁(Golden Mandheling)，苏门答腊出产的曼特宁是世间最的咖啡之一，香滑醇厚，比曾经的爪哇咖啡口味更重些，余味稍长久些，购买时需认准金色蝴蝶的商标。